新建赣州至深圳铁路进入广东省后，沿粤赣高速公路南下经和平东站后沿京九铁路至龙川设龙川西站，预留龙川至龙岩铁路接轨条件。沿东江南下至河源于江东新区迎客大道附近设河源东站，出站后跨东江沿京九铁路东侧南行经博罗县麻陂镇设博罗北站，在惠州市小金口设惠州北站（预留广汕铁路联络线的接入条件），出惠州北站向南跨东江、京九铁路、广深铁路后于东莞市塘厦镇西侧设塘厦站,出站后与广深港高铁并行在既有光明城站旁新设光明城站，出站后在羊台山隧道出岔，联络线引入深圳北站。线路全长 297.026 正线公里。桥隧比为 86.87%。